Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms