Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms