Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMSP52788 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMSP52788 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMSP52788 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMSP52788 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms