Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms