Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRMP28827 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRMP28827 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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