Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ABCD3P28288 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ABCD3P28288 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms