Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRHP20396 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRHP20396 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRHP20396 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRHP20396 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRHP20396 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRHP20396 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRHP20396 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRHP20396 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRHP20396 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRHP20396 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRHP20396 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRHP20396 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms