Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CXCL3P19876 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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