Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SERPIND1P05546 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SERPIND1P05546 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms