Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms