Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR3O43761 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR3O43761 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms