Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCNQ3O43525 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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