Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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