Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E5RI56 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E5RI56 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
E5RI56 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms