Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SOBPA7XYQ1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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