Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC4Q9Y296 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC4Q9Y296 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms