Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BRPF3Q9ULD4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms