Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
MLH3Q9UHC1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MLH3Q9UHC1 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms