Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP35Q9P2H5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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