Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RLIMQ9NVW2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms