Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DEPPQ9NTK1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DEPPQ9NTK1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms