Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC52A2Q9HAB3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC52A2Q9HAB3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms