Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG2BQ96BY7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms