Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPRTQ96BW1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPRTQ96BW1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms