Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NCSTNQ92542 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms