Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX33Q8WV41 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms