Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FNDC9Q8TBE3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms