Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GDPD3Q7L5L3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms