Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf135Q5VTT2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms