Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COL24A1Q17RW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL24A1Q17RW2 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms