Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM187BQ17R55 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms