Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TLR1Q15399 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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