Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCOLCEQ15113 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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