Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NCF4Q15080 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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NCF4Q15080 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NCF4Q15080 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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