Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFFO1Q0D2I5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms