Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RUNX1T1Q06455 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms