Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CENPCQ03188 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CENPCQ03188 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms