Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DSG1Q02413 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms