Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EXOSC10Q01780 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EXOSC10Q01780 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms