Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CACNA1DQ01668 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms