Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASP7P55210 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASP7P55210 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CASP7P55210 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms