Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSR1P43307 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms