Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5CP41229 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5CP41229 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms