Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CRABP1P29762 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms