Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLD1P28340 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLD1P28340 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLD1P28340 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLD1P28340 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POLD1P28340 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms