Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GP1BBP13224 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms