Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
POLR1AO95602 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR1AO95602 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms