Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms