Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms