Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HHLA1C9JL84 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HHLA1C9JL84 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms